Fanfare Concordia wordt georganiseerd door een bestuur en twee commissies. Het bestuur bepaalt het beleid en geeft richting aan de commissies. De commissies die worden onderkend zijn de Programma Commissie en de Jeugd Commissie. De Programma Commissie is verantwoordelijk voor het muzikale programma. De Jeugd Commissie is verantwoordelijk voor werving en begeleiding van jeugdleden.

De commissies bestaan uit leden van de eigen vereniging.